e-Ticaretin sayısız avantajı olduğu gibi birçok dezavantajıda vardır.
e-Ticaret in en büyük dezavantajlarından biri müşteri ve satıcının karşı karşıya gelemememsidir. Alıcı ürünü canlı göremediği için hem ne aldığını bilmemektedir hemde ürünün gelmesi için belli bir süre beklemektedir. Sanal satıştaki ürün iadeleri gerçek satışa oranla daha fazla olmaktadır bunun nedeni ise dediğimiz gibi alıcının ürünü canlı görememiş olmasıdır. Birçok sitede sözleşme kullanıcı ile doğrudan paylaşılmadığı için sahte ürün vb. alabilme olasılığımızda fazladır.